Οι πόροι του ΕΚΟΕΜΝ προέρχονται

α. Από εισφορές όλου του εν ενεργεία στρατιωτικού προσωπικού του Π.Ν. και του Λ.Σ.(1% Β.Μ.+Ε.Χ.Υ.)

β. Από κρατήσεις ποσοστού 5% επί των οδοιπορικών εξόδων εκτέλεσης υπηρεσίας και μετάθεσης εξωτερικού-εσωτερικού και τις πάσης φύσεως αποζημιώσεις εξωτερικού των στρατιωτικών του Π.Ν. και του Λ.Σ.

γ.Από ειφορές 5% από το μηνιαίο μέρισμα των μερισματούχων καθώς και 3% επί του μερίσματος, για κάθε χρόνο αναγνώρισης στο ΕΚΟΕΜΝ.

δ.Από δωρεές,κληρονομιές και κληροδοτήματα, καθώς και κάθε άλλη, απο χαριστική πράξη και παροχή, που γίνεται με σκοπό την ενίσχυση του ΕΚΟΕΜΝ

ε.Εισφορές απο δραστηριότητες εκτος των προϋπολογισμών ΥΠΕΘΑ/ΓΕΝ όπως κέρδη εκμεταλλεύσεων, διαχειρίσεων, μισθώματα στρατιωτικών οικημάτων, κέρδη ΠΟΝ, θερέτρων  κλπ